无创胎儿亲子鉴定就是通过取孕母静脉血进行检测以判断胎儿的生物学父亲人流亲子鉴定。
我们知道孕母外周血中包含有胎儿DNA片段，所以对孕母外周血进行检测就可以了解胎儿情况。临床上已大量使用的无创产前胎儿染色体非整倍体异常检测技术就是建立在此基础之上。
取孕母外周血如静脉血后，分离DNA（母亲DNA和胎儿DNA），再进行DNA序列分析即测序，结果分析就可知道哪些DNA是来源于母亲，哪些是来自于胎儿。
我们知道胎儿的DNA一半来自母亲，一半来自父亲。测序结果不能区分来胎儿自母亲的DNA，但能告知来自父亲的DNA。所以只要把来自父亲的DNA和可疑父亲的DNA进行比对就可知晓其是不是生物学父亲。
由于DNA测序是对人全基因组进行测序，所以只要显示有差异或不同的位置或位点都可进行比对，这比传统的亲子鉴定方法所运用的微卫星位点数要多很多，因而准确率会更高。
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