可以。怀孕3个月即12周孕期可以做亲子鉴定，可以做无创胎儿亲子鉴定，抽取孕妇外周血（静脉血）10ml做母血分型检测，对其中游离的胎儿cfDNA做鉴定。
友情提醒：
怀孕期间做亲子鉴定/胎儿亲子鉴定
16年司办通[2016]40号文件中规定：
司法鉴定机构不得接受当事人委托对孕妇开展产前亲子鉴定或者胎儿性别鉴定。
因此只能做个人鉴定不能做司法鉴定（非特殊情况）。
三种方法：
1、无创胎儿亲子鉴定
16年最新推出的方法，只需要抽取12孕周以上孕妇外周血（静脉血）10ml，进行母血分型检测，即可对其中游离的胎儿cfDNA进行鉴定。
无创胎儿亲子鉴定需要在12孕周之后做，小于12孕周有很大的可能，大多数孕妇外周血中游离的胎儿DNA量不够，做不出来结果需要重新抽血鉴定。
2、绒毛亲子鉴定；3、羊水亲子鉴定【不予采纳】
传统方法，绒毛鉴定（10-16孕周）、羊水鉴定（17-26孕周）需要正规医院申请手术取样，该手术有一定的入侵性和流产风险，另外在政策的限制下，目前手术申请不到。
如果一定要在怀孕期间做胎儿亲子鉴定：
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